Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3dP35276 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3dP35276 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms