Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Stfa3P35173 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms