Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc11P31313 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc11P31313 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms