Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk4P30285 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms