Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BgnP28653 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BgnP28653 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BgnP28653 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BgnP28653 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BgnP28653 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BgnP28653 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BgnP28653 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BgnP28653 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BgnP28653 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BgnP28653 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BgnP28653 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BgnP28653 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BgnP28653 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BgnP28653 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BgnP28653 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BgnP28653 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BgnP28653 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms