Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms