Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja8P28236 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja8P28236 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja8P28236 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms