Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vav1P27870 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vav1P27870 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vav1P27870 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vav1P27870 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vav1P27870 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms