Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde6aP27664 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde6aP27664 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms