Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra2P26048 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra2P26048 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra2P26048 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms