Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RdxP26043 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RdxP26043 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RdxP26043 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RdxP26043 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RdxP26043 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RdxP26043 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RdxP26043 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RdxP26043 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RdxP26043 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RdxP26043 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RdxP26043 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RdxP26043 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RdxP26043 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RdxP26043 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RdxP26043 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RdxP26043 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RdxP26043 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RdxP26043 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RdxP26043 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RdxP26043 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RdxP26043 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RdxP26043 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RdxP26043 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RdxP26043 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RdxP26043 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RdxP26043 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms