Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LynP25911 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LynP25911 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LynP25911 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LynP25911 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LynP25911 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LynP25911 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LynP25911 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LynP25911 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LynP25911 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LynP25911 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LynP25911 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LynP25911 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LynP25911 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LynP25911 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LynP25911 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LynP25911 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LynP25911 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LynP25911 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LynP25911 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LynP25911 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LynP25911 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LynP25911 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LynP25911 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LynP25911 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LynP25911 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LynP25911 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms