Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myf5P24699 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myf5P24699 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms