Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms