Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45bP22339 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms