Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ntf3P20181 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms