Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PdgfaP20033 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PdgfaP20033 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms