Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18528 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18528 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P18528 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18528 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18528 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18528 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18528 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18528 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18528 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18528 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18528 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18528 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms