Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRAP18433 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRAP18433 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
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