Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs1P17533 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms