Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CnpP16330 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CnpP16330 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CnpP16330 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CnpP16330 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CnpP16330 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CnpP16330 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CnpP16330 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CnpP16330 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CnpP16330 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CnpP16330 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CnpP16330 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CnpP16330 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CnpP16330 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CnpP16330 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CnpP16330 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CnpP16330 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CnpP16330 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CnpP16330 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CnpP16330 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CnpP16330 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CnpP16330 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CnpP16330 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CnpP16330 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CnpP16330 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CnpP16330 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CnpP16330 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CnpP16330 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CnpP16330 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CnpP16330 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CnpP16330 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CnpP16330 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CnpP16330 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CnpP16330 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CnpP16330 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CnpP16330 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CnpP16330 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CnpP16330 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CnpP16330 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CnpP16330 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CnpP16330 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CnpP16330 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CnpP16330 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CnpP16330 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CnpP16330 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CnpP16330 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CnpP16330 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms