Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr1P16092 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms