Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl1P12850 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcl1P12850 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms