Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd1d1P11609 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms