Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtaP09225 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LtaP09225 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtaP09225 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtaP09225 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtaP09225 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtaP09225 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtaP09225 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtaP09225 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtaP09225 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms