Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax1P09084 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax1P09084 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax1P09084 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax1P09084 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms