Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prm2P07978 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prm2P07978 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms