Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TtrP07309 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TtrP07309 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtrP07309 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtrP07309 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtrP07309 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TtrP07309 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TtrP07309 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TtrP07309 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TtrP07309 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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