Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa1P05366 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa1P05366 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa1P05366 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa1P05366 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa1P05366 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa1P05366 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa1P05366 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Saa1P05366 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa1P05366 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms