Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04219 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04219 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04219 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P04219 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P04219 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04219 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04219 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04219 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04219 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04219 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04219 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04219 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04219 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04219 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04219 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04219 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04219 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04219 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04219 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04219 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04219 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04219 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04219 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04219 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04219 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04219 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms