Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01852 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01852 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01852 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01852 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01852 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01852 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01852 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01852 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01852 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01852 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01852 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01852 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01852 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01852 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01852 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01852 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01852 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01852 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01852 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01852 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01852 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01852 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01852 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01852 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01852 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01852 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01852 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01852 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01852 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01852 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01852 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01852 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01852 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms