Protein–RNA interactions for Protein: P01845

Iglc3, Ig lambda-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iglc3P01845 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Iglc3P01845 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iglc3P01845 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Iglc3P01845 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms