Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01788 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01788 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01788 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01788 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01788 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01788 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01788 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01788 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01788 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01788 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01788 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01788 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01788 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01788 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01788 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01788 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01788 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01788 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01788 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01788 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01788 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01788 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01788 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01788 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01788 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms