Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFP01133 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFP01133 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFP01133 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGFP01133 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFP01133 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFP01133 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFP01133 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFP01133 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFP01133 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFP01133 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFP01133 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFP01133 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFP01133 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFP01133 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms