Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbbp9O88851 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp9O88851 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms