Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30O88574 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30O88574 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sap30O88574 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30O88574 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms