Protein–RNA interactions for Protein: O88531

Ppt1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt1O88531 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppt1O88531 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppt1O88531 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppt1O88531 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms