Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnmt3bO88509 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3bO88509 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnmt3bO88509 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms