Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb5O70309 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb5O70309 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms