Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtogO55225 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtogO55225 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtogO55225 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtogO55225 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtogO55225 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtogO55225 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
OtogO55225 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtogO55225 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtogO55225 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
OtogO55225 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtogO55225 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtogO55225 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtogO55225 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtogO55225 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtogO55225 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtogO55225 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtogO55225 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtogO55225 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtogO55225 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtogO55225 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtogO55225 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtogO55225 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtogO55225 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtogO55225 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
OtogO55225 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtogO55225 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OtogO55225 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms