Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt5hO55201 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms