Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rpl35aO55142 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rpl35aO55142 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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