Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp10O55123 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp10O55123 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp10O55123 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms