Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trdmt1O55055 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trdmt1O55055 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trdmt1O55055 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms