Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nck2O55033 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nck2O55033 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck2O55033 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nck2O55033 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms