Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarce1O54941 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarce1O54941 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms