Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CrxO54751 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CrxO54751 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CrxO54751 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CrxO54751 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CrxO54751 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CrxO54751 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CrxO54751 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CrxO54751 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CrxO54751 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CrxO54751 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CrxO54751 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CrxO54751 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CrxO54751 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CrxO54751 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CrxO54751 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CrxO54751 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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