Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cavin1O54724 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin1O54724 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms