Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EdaO54693 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EdaO54693 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EdaO54693 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EdaO54693 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EdaO54693 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EdaO54693 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EdaO54693 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EdaO54693 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EdaO54693 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EdaO54693 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EdaO54693 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EdaO54693 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EdaO54693 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EdaO54693 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EdaO54693 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EdaO54693 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EdaO54693 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EdaO54693 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EdaO54693 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EdaO54693 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EdaO54693 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EdaO54693 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EdaO54693 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EdaO54693 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EdaO54693 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EdaO54693 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EdaO54693 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EdaO54693 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EdaO54693 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EdaO54693 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms