Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab33bO35963 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms